La Tropa Wakan Powwow se organiza a través del sistema de patrullas. Cada patrulla está compuesta de un Guía y un Subguía que coordinan la actividad de la misma y sirven de interlocutores entre el Kraal y los scouts.
Además, el sistema de "tropa vertical" diseñado por Baden Powell, establece una serie de órganos que ayudan a distribuir las funciones dentro de la unidad:
- Consejo de Alta Patrulla: reúne a los guías y subguías de todas las patrullas de la Tropa junto con los jefes de la unidad.
- Consejo de Patrulla: los miembros de la patrulla se reúnen en él para discutir acerca de las tareas a desempeñar. El Guía responde a las cuestiones que le son planteadas por sus scouts.
- Corte de Honor: agrupa a todos los scouts de la Tropa ("promesados").
- Consejo de Unidad: es una asamblea en la que participan todos los miembros de la unidad. En ella se plantean cuaestiones de carácter general que afectan a la Tropa en su conjunto.
